Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Laptm4aQ60961 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Laptm4aQ60961 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Laptm4aQ60961 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Laptm4aQ60961 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Laptm4aQ60961 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Laptm4aQ60961 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Laptm4aQ60961 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Laptm4aQ60961 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Laptm4aQ60961 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Laptm4aQ60961 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms