Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Meis1Q60954 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Meis1Q60954 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Meis1Q60954 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Meis1Q60954 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Meis1Q60954 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Meis1Q60954 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Meis1Q60954 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Meis1Q60954 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Meis1Q60954 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Meis1Q60954 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Meis1Q60954 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Meis1Q60954 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Meis1Q60954 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Meis1Q60954 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Meis1Q60954 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Meis1Q60954 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Meis1Q60954 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Meis1Q60954 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Meis1Q60954 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Meis1Q60954 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Meis1Q60954 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Meis1Q60954 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Meis1Q60954 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Meis1Q60954 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Meis1Q60954 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Meis1Q60954 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Meis1Q60954 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Meis1Q60954 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Meis1Q60954 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Meis1Q60954 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Meis1Q60954 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Meis1Q60954 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Meis1Q60954 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Meis1Q60954 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Meis1Q60954 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Meis1Q60954 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Meis1Q60954 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms