Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Neurod1Q60867 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms