Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r1bQ60829 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp1r1bQ60829 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms