Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot7Q60809 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms