Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Sin3aQ60520 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sin3aQ60520 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sin3aQ60520 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms