Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4H9

Ncoa4, Nuclear receptor coactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa4Q5U4H9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncoa4Q5U4H9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncoa4Q5U4H9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncoa4Q5U4H9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncoa4Q5U4H9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncoa4Q5U4H9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncoa4Q5U4H9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncoa4Q5U4H9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms