Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scaf1Q5U4C3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf1Q5U4C3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms