Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ggnbp2Q5SV77 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ggnbp2Q5SV77 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms