Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH8

Cyb5d2, Neuferricin, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb5d2Q5SSH8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyb5d2Q5SSH8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyb5d2Q5SSH8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms