Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rapgef6Q5NCJ1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rapgef6Q5NCJ1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms