Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT8

Pnma5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, mousemouse

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Length 618 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma5Q5DTT8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnma5Q5DTT8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Pnma5Q5DTT8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Pnma5Q5DTT8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Pnma5Q5DTT8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pnma5Q5DTT8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms