Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Spag9Q58A65 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spag9Q58A65 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Spag9Q58A65 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms