Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Pdp2Q504M2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Pdp2Q504M2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdp2Q504M2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Pdp2Q504M2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Pdp2Q504M2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Pdp2Q504M2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Pdp2Q504M2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdp2Q504M2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdp2Q504M2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Pdp2Q504M2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Pdp2Q504M2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdp2Q504M2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdp2Q504M2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdp2Q504M2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdp2Q504M2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdp2Q504M2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdp2Q504M2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdp2Q504M2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdp2Q504M2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdp2Q504M2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdp2Q504M2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Pdp2Q504M2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdp2Q504M2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdp2Q504M2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdp2Q504M2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdp2Q504M2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdp2Q504M2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdp2Q504M2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms