Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt35Q497I4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms