Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cfap65Q3V0B4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cfap65Q3V0B4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms