Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms