Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chpf2Q3UU43 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms