Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhdc9Q3USL1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms