Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms