Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cog7Q3UM29 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms