Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms