Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc61Q3UJV1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc61Q3UJV1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc61Q3UJV1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc61Q3UJV1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc61Q3UJV1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc61Q3UJV1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc61Q3UJV1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc61Q3UJV1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc61Q3UJV1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc61Q3UJV1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc61Q3UJV1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc61Q3UJV1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc61Q3UJV1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc61Q3UJV1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc61Q3UJV1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc61Q3UJV1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc61Q3UJV1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc61Q3UJV1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc61Q3UJV1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc61Q3UJV1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc61Q3UJV1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc61Q3UJV1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc61Q3UJV1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc61Q3UJV1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc61Q3UJV1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc61Q3UJV1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc61Q3UJV1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc61Q3UJV1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc61Q3UJV1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc61Q3UJV1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms