Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U6N9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U6N9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U6N9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U6N9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U6N9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U6N9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U6N9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U6N9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U6N9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U6N9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q3U6N9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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