Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Smarca4Q3TKT4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms