Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGW2

Eepd1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eepd1Q3TGW2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eepd1Q3TGW2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eepd1Q3TGW2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Eepd1Q3TGW2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eepd1Q3TGW2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eepd1Q3TGW2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eepd1Q3TGW2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eepd1Q3TGW2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eepd1Q3TGW2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eepd1Q3TGW2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eepd1Q3TGW2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eepd1Q3TGW2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eepd1Q3TGW2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eepd1Q3TGW2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eepd1Q3TGW2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eepd1Q3TGW2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eepd1Q3TGW2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eepd1Q3TGW2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eepd1Q3TGW2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Eepd1Q3TGW2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Eepd1Q3TGW2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms