Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms