Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trim71Q1PSW8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms