Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam171bQ14CH0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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