Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ptchd1Q14B62 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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