Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b3Q0VF55 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms