Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rundc1Q0VDN7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms