Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn2bQ0KL01 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ubxn2bQ0KL01 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms