Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttc21bQ0HA38 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms