Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tgm3Q08189 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms