Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ddr1Q03146 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddr1Q03146 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddr1Q03146 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddr1Q03146 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddr1Q03146 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddr1Q03146 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddr1Q03146 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddr1Q03146 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddr1Q03146 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms