Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms