Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbp1Q00915 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms