Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VldlrP98156 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VldlrP98156 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VldlrP98156 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VldlrP98156 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VldlrP98156 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VldlrP98156 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms