Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lama4P97927 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama4P97927 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lama4P97927 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama4P97927 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lama4P97927 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lama4P97927 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lama4P97927 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama4P97927 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama4P97927 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms