Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas1P97459 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas1P97459 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas1P97459 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas1P97459 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms