Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DccP70211 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DccP70211 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DccP70211 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DccP70211 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DccP70211 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DccP70211 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DccP70211 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DccP70211 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DccP70211 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DccP70211 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DccP70211 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DccP70211 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DccP70211 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DccP70211 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DccP70211 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DccP70211 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DccP70211 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DccP70211 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DccP70211 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DccP70211 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DccP70211 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DccP70211 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DccP70211 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DccP70211 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DccP70211 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DccP70211 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DccP70211 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DccP70211 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DccP70211 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DccP70211 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DccP70211 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DccP70211 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DccP70211 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DccP70211 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DccP70211 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DccP70211 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DccP70211 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DccP70211 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DccP70211 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DccP70211 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DccP70211 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DccP70211 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DccP70211 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DccP70211 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DccP70211 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DccP70211 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DccP70211 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DccP70211 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DccP70211 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DccP70211 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DccP70211 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DccP70211 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DccP70211 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DccP70211 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DccP70211 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DccP70211 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DccP70211 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DccP70211 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DccP70211 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DccP70211 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DccP70211 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DccP70211 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DccP70211 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DccP70211 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DccP70211 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DccP70211 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DccP70211 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DccP70211 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DccP70211 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DccP70211 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DccP70211 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DccP70211 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DccP70211 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DccP70211 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DccP70211 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DccP70211 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DccP70211 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DccP70211 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DccP70211 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DccP70211 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DccP70211 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DccP70211 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DccP70211 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DccP70211 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DccP70211 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DccP70211 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DccP70211 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DccP70211 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DccP70211 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DccP70211 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DccP70211 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DccP70211 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DccP70211 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DccP70211 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DccP70211 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DccP70211 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DccP70211 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DccP70211 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DccP70211 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms