Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpd1P62315 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms