Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps11P62281 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps11P62281 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps11P62281 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps11P62281 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps11P62281 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms