Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap25P60879 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap25P60879 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap25P60879 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap25P60879 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snap25P60879 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap25P60879 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Snap25P60879 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snap25P60879 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snap25P60879 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms