Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CgnP59242 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CgnP59242 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CgnP59242 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CgnP59242 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CgnP59242 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CgnP59242 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CgnP59242 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CgnP59242 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CgnP59242 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CgnP59242 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CgnP59242 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CgnP59242 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CgnP59242 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CgnP59242 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CgnP59242 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CgnP59242 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CgnP59242 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CgnP59242 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CgnP59242 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CgnP59242 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CgnP59242 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CgnP59242 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CgnP59242 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CgnP59242 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CgnP59242 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CgnP59242 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CgnP59242 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CgnP59242 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CgnP59242 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CgnP59242 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CgnP59242 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CgnP59242 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CgnP59242 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CgnP59242 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CgnP59242 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CgnP59242 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CgnP59242 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CgnP59242 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CgnP59242 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CgnP59242 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CgnP59242 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CgnP59242 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CgnP59242 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CgnP59242 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CgnP59242 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CgnP59242 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CgnP59242 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CgnP59242 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CgnP59242 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CgnP59242 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CgnP59242 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CgnP59242 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CgnP59242 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CgnP59242 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CgnP59242 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CgnP59242 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CgnP59242 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CgnP59242 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CgnP59242 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CgnP59242 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CgnP59242 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CgnP59242 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CgnP59242 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CgnP59242 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CgnP59242 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CgnP59242 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CgnP59242 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CgnP59242 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CgnP59242 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CgnP59242 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CgnP59242 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CgnP59242 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CgnP59242 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CgnP59242 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CgnP59242 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CgnP59242 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CgnP59242 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CgnP59242 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CgnP59242 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CgnP59242 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CgnP59242 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CgnP59242 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CgnP59242 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CgnP59242 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CgnP59242 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CgnP59242 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CgnP59242 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CgnP59242 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CgnP59242 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CgnP59242 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CgnP59242 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CgnP59242 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CgnP59242 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CgnP59242 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CgnP59242 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CgnP59242 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CgnP59242 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CgnP59242 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CgnP59242 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms