Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcif1P59114 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pcif1P59114 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pcif1P59114 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcif1P59114 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcif1P59114 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcif1P59114 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcif1P59114 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcif1P59114 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcif1P59114 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcif1P59114 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcif1P59114 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcif1P59114 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcif1P59114 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcif1P59114 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcif1P59114 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcif1P59114 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcif1P59114 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcif1P59114 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcif1P59114 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pcif1P59114 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pcif1P59114 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pcif1P59114 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcif1P59114 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcif1P59114 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcif1P59114 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcif1P59114 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcif1P59114 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms