Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Paxbp1P58501 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Paxbp1P58501 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Paxbp1P58501 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Paxbp1P58501 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms