Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms