Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp5P56399 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp5P56399 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp5P56399 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp5P56399 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp5P56399 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp5P56399 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp5P56399 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp5P56399 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms